ja das kann vieles sein.

1. mach zunächst mal beim quell- und ziellaufwerk ein chkdsk:
arbeitsplatz->rechtsklick aufs laufwerk->eigenschaften->extras->fehlerüberprüfung: "dateisystemfehler automatisch korrigieren".

wie gesagt bei beiden laufwerken - das kann ne weile dauern und u.u. einen neustart erfordern..

2. probiere mal einen anderen usb - port.

3. um windows+treiber als fehlerursache auszuschließen, eine live cd ausprobieren:
lese hier unter dem punkt "ausprobieren" (und "details zur desktop-cd")

das system funktioniert für dich so wie windows, d.h. doppelklick, kontextmenü und fenster sind ähnlich.. du packst das schon..

deine festplatten findest du dort unter orte->computer, ist aber auch in der anleitung beschrieben. lösche auf deinen festplatten aber nichts, das ist dann trotz live cd weg, wie auch unter windows ;)

4. deiner externe festplatte mal in ein anderes gehäuse packen.

wenn nix hilft, schreib nochmal...