hi,
verstehe dein Problem nicht so ganz. Außer, das Programme als Standardspeicherverzeichnis die eigenen Dateien benutzen, gibt es doch keine unmittelbaren Verknüpfungen der eigenen Dateien mit den Programmen. Und die Standardspeicherverzeichnisse lassen sich im jeweiligen Programm einstellen. Außerdem kannst du jeden beliebigen Ordner als eigene Dateien definieren und diesen somit zum Systemordner machen. Vor Windowsstart eine Datgei oder einen Ordner umbenennen geht meines Wissens nicht, außer vielleicht, wenn du z. B. mit einer Linux Live Version bootest (Ubuntu, Knoppix) und dann ein umbenennen möglich ist.

Das Problem ist, dass mir der Ordnername nicht mehr zusagt (bei mir heißen der Ordner nicht Eigene Dateien), ich ihn nun gerne ändern würde, aber durch ein paar Verknüpfungen mit Programmen (an die ich mich nicht alle erinnere) scheint die Funktion "Umbenennen" nicht auf? Gibts da eine Lösung?

Versuch mal deinen umbenannten Eigene Dateien Ordner zu markieren und die F2 Taste zu drücken.

Ansonsten verstehe ich auch nicht so ganz was du meinst.